Colossal Biosciences周三宣布据 TechCrunch 独家报道,该公司推出一个新的人工智能平台,以帮助加速其复活灭绝物种的工作。

该平台名为 GenoMorph,利用先进的 3D 形态学、比较基因组学和发育生物学,在基因数据有限的情况下识别可在去灭绝项目中编辑的基因。该公司正将其用于复活渡渡鸟的工作,因为可供研究的渡渡鸟基因组十分有限。

例如,该公司目前只有一份渡渡鸟基因组,而在其猛犸象去灭绝项目中,它已能获得 100 份基因组。公司表示,猛犸象的 DNA 更为丰富,因为这种动物生活的寒冷气候比渡渡鸟生活的热带地区更能保存 DNA。

“通常,科学家可以比较许多基因组,以了解哪些遗传差异导致了某些性状,”Colossal 首席执行官兼联合创始人 Ben Lamm 告诉 TechCrunch。“对于灭绝物种的古代 DNA,我们没有这种条件,因为它们的 DNA 极其有限,我们只能获得少量完整基因组。”

Lamm 说,为了构建 GenoMorph,公司从“鸡、鹌鹑、鸭子和鸽子”中收集了大量发育数据,并将其与“来自 70 多个鸟类物种的遗传信息和 3D 头骨测量数据”相结合。他说,构建这个平台花了一年多的时间,它也建立在公司多年来在去灭绝方面的工作之上。

“人工智能会学习不同鸟类发育喙和面部结构时哪些 DNA 区域处于活跃状态,并利用这些信息预测哪些基因开关可能赋予了渡渡鸟标志性的外观。”他说,可以把该平台想象成一张“渡渡鸟基因组的藏宝图”,GenoMorph 不是在一堆潜在的遗传差异中逐一搜寻,而是帮助 Colossal 团队只找到真正重要的遗传差异。

图片来源:Colossal Labs

“到目前为止,我们已经为渡渡鸟的颅面形态识别出了大约 2,300 个有前景的 DNA 编辑靶点,现在可以在实验室中测试它们,”他继续说道。他说,GenoMorph 将帮助公司解决其在尝试让动物去灭绝过程中最大的瓶颈之一——找出究竟是哪些变化让一个灭绝物种变得独特。但 Lamm 表示,科学家还需要测试这些编辑能否创造出他们所需的物理特征。

“我们开发了一套新系统,利用脂质纳米颗粒将基因编辑工具直接递送到正在发育的鸟类胚胎中,”他说。这将帮助团队了解某些基因变化如何影响鸟类的发育,“而不必等待一个完整的繁殖周期,也就是需要鸟类达到性成熟。”

该公司周三还宣布,其尼科巴鸠种群现在已有 36 只鸟,并且已成功制造出会发育成卵子和精子的关键细胞。

“由于尼科巴鸠是渡渡鸟现存的最近亲,这些细胞是我们创造携带渡渡鸟特征鸟类的战略中的关键部分,”他说。接下来,公司希望在实验室中证明 GenoMorph 的预测。“最令人兴奋的是,我们正到达一个节点,我们一直在开发的各项技术开始汇聚在一起,并帮助我们在生命之树一个完全不同的部分开展的其他项目,”Lamm 继续说道。

当被问及以这种方式编辑基因是否安全时,Lamm 表示,开发像 GenoMorph 这样的技术的意义在于让基因工程“更精确、更可控、更可测试”。他说,该产品本身并不编辑基因,而是帮助他们的团队识别哪些基因变化值得研究。

“识别出一个潜在的编辑并不意味着我们会立即将其引入动物体内,或假定它是安全的,”他继续说道。“我们越能精确地识别和验证这些变化,我们在整个过程中的决策就越有依据。”

与此同时,Colossal Biosciences 的最新技术已经获得了 XPRIZE 创始人 Peter Diamandis 的信任票。Diamandis 是 Colossal 的投资者,宣布周三表示,他已创立了一家新的风投公司,NeoGenesis Capital,旨在支持那些使用 Colossal Biosciences 可编程生物学平台的公司,覆盖健康、农业和保护领域。

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Dominic-Madori Davis 是 TechCrunch 的高级风险投资和初创企业记者。她常驻纽约市。

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